Até o século XVIII, quando ocorreu a chegada dos primeiros colonizadores de origem portuguesa, a Serra da Mantiqueira, na qual se localiza o município, era território habitado pelos índios puris[7].
O município criado em 1991 foi, a princípio, administrado pelo Conselho Popular de Quatis, presidido pela irmã Elizabeth Alves, enquanto não se fazia eleição para prefeito. Coube a este conselho fazer a ligação entre as necessidades da nossa população e o prefeito de Barra Mansa, até que o Tribunal Regional Eleitoral marcou a primeira eleição para a prefeitura em 3 de outubro de 1992, sendo então eleito José Laerte d'Elias para o período 1993/1996.
O segundo prefeito eleito foi Alfredo José de Oliveira para o período de 1997/2000, sendo substituído por José Laerte d' Elias no período de 2001/2004. Alfredo foi novamente eleito para o mandato 2005/2008. Em 2008, José Laerte D'Elias foi eleito pela terceira vez para o mandato 2009/2012. Atualmente, o prefeito do município é o senhor Bruno de Souza,que foi eleito para o período de 2013 a 2016, e posteriormente, primeiro prefeito reeleito de Quatis, para o período de 2017 a 2020.
Com a eleição do primeiro prefeito, em 1992, foi eleita também a primeira câmara de vereadores, que foi constituída por: Aroldo Cabral, Engrácia Vera Maia Rafael, Rosa Idalina Nunes de Macedo, José Cardoso Fonseca, Geraldo de Souza Marques, Cláudio Luiz de Lima, Altamyr Gomes de Oliveira, Raimundo Valeriano da Silva e Hugo de Elias. Coube a esta Câmara elaborar a nossa Lei Orgânica, promulgada em 30 de junho de 1993, na presidência de Aroldo Cabral.
Com o início da administração própria, houve a municipalização da educação e da saúde.
A principal atividade econômica do município é a agricultura.
A principal atividade econômica do município é a agricultura.
Desde o início de 2009, a cidade, assim como sua vizinha Porto Real, sofria com o bloqueio da única ponte que liga os dois municípios. A ponte de estrutura metálica é histórica e foi inutilizada devido a danos críticos causados pelas fortes chuvas que assolaram a região. Desde agosto de 2009, a ponte está sendo reformada e reestruturada, graças a uma parceria firmada entre a prefeitura e o Departamento de Estrada de Rodagem, órgão do Governo do Estado do Rio de Janeiro. A previsão era de que a ponte ficasse pronta até março de 2010, sendo que os motoristas teriam que usar uma rota alternativa, que aumentava em 7 quilômetros o percurso. Hoje, a ponte metálica que liga o Município de Porto Real a Quatis já está concluída.